医药净化工程车间对于空气的洁净度要求非常的高，从万级、十万级到百万等级要求，分别对应不同的空气过滤器的选择。洁净车间空气过滤器中级和高等级过滤器；中效空气过滤器应根据小于或等于额定风量选择；中效空气过滤器应集中在净化工程空调的正压段。如100级以下选择A类或B类，100级以上则需要选择C类过滤器；高温高湿条件下宜选用金属分隔板和金属框架的过滤器；有防腐要求的宜选用塑料分隔板和塑料框架的过滤器；有防火要求的，过滤器所有材料应为不燃性等等。

医药净化工程空调系统卫生状况检测结果中，风管内表面积尘量超过GB 19210、GB 50365及WS 394 的规定时，应自行清洗(具有相关清洗资质），或委托专门清洗机构对大型空调系统清洗，要求通风系统按照GB 19210、 GB 50365及WS/T 396的要求进行清洗，使其符合GB 19210、GB 50365及WS 394的规定、规范。

医院怀疑暴发传染或疑似暴发，与具体的当时环境有关时，应进行目标微生物检测。并根据医院传染暴发的具体情况，规定抽查监测的频率和抽检房间的覆盖比例。其监测方法及结果的判定，应符合GB 15982 的规定。如果病菌菌落超过GB 15982规定的标准值，应立即关闭该区域大型空调系统，并对其采取检查、清洗、消菌等整改措施然后重新检测，菌落总数符合GB 15982规定的标准值后方可再次投入使用。

医院医药净化工程建筑物某区域内，发现可能通过大型空调通风系统扩散的传染病例，或者疑似传染病、有毒有害气体、粉尘等时，运行操作人员应立即关闭该区域全部风口，或立即停止该区域大型空调末端设备。